freee会計とマネーフォワード クラウド確定申告のどちらを選ぶかは、インボイス登録をしているかどうかで決まります。登録している人は消費税の申告ができるプランが必要で、その最安プランは年払いでfreeeが23,760円、マネーフォワードが15,360円です（いずれも税抜・2026年9月時点）。登録していない人の最安プランは、11,760円と10,800円です。
会計ソフトの比較記事は多くありますが、フリーランスのWeb制作者に関わる点まで並べたものは多くありません。制作の売上はStripeやPayPalで入ってくることがあり、取引先によってはインボイスの登録も求められます。どのプランで何ができるかを確かめないまま選ぶと、申告の時期になってプランを上げ直すことになります。
この記事では、両社の公式ページとヘルプの記載をもとに、料金、インボイスに必要なプラン、Stripe・PayPalの売上の取り込み、請求書、無料期間を比べます。最後に、登録状況と売上の経路から選ぶ判断表と、無料期間中に確かめる項目をまとめます。料金と機能は2026年9月19日時点の公式ページによります。
結論：登録済みか免税かで選ぶプランが変わる
先に結論を表にします。インボイス登録の有無で、選ぶべきプランと年額の差が変わります。
| 立場 | freee会計で選ぶプラン | マネーフォワードで選ぶプラン | 年額の差（年払い・税抜） |
|---|---|---|---|
| インボイス登録済み（消費税の申告が必要） | スタンダード 23,760円 | パーソナル 15,360円 | マネーフォワードが8,400円安い |
| 免税のまま（消費税の申告は不要） | スターター 11,760円 | パーソナルミニ 10,800円 | マネーフォワードが960円安い |
インボイス登録している人にとって、両社の差は年8,400円です。免税のままなら差は年960円なので、料金よりも売上の取り込み方や画面の使いやすさで選べます。
ただし料金だけでは決まりません。PayPalで外貨の売上がある人は、取り込める範囲が両社で違います。詳しくは「Stripe・PayPalの売上の取り込み」の節で比べます。
料金比較（年払い・月払い・税抜）
個人事業主向けのプランを並べます。表示はすべて税抜で、両社とも料金ページに「税抜」と明記しています。
freee会計（個人事業主向け）
| プラン | 年払い | 月払い | 消費税の申告 |
|---|---|---|---|
| スターター | 11,760円／年（月あたり980円） | 1,780円／月 | できない |
| スタンダード | 23,760円／年（月あたり1,980円） | 2,980円／月 | できる |
| プレミアム | 39,800円／年 | 年払いのみ | できる |
出典：freee会計 個人事業主向け料金プラン（2026年9月19日時点）。記帳を任せる「入力おまかせ」プラン（年49,800円）もありますが、この記事の比較からは外しています。
マネーフォワード クラウド確定申告（個人向け）
| プラン | 年払い | 月払い | 消費税の申告 |
|---|---|---|---|
| パーソナルミニ | 10,800円／年（月あたり900円） | 1,280円／月 | できない |
| パーソナル | 15,360円／年（月あたり1,280円） | 1,680円／月 | できる |
| パーソナルプラス | 35,760円／年 | 年払いのみ | できる |
出典：マネーフォワード クラウド確定申告 料金（2026年9月19日時点）。
月払いで1年使うと、freeeのスタンダードは35,760円、マネーフォワードのパーソナルは20,160円です。1年以上使うつもりなら、どちらも年払いの方が安くなります。
インボイス登録者に必要なプラン
インボイス登録をすると、原則として消費税の申告が必要になります。両社とも、いちばん安いプランでは消費税の申告ができません。
| freee会計 | マネーフォワード クラウド確定申告 | |
|---|---|---|
| 消費税の申告ができるプラン | スタンダード以上 | パーソナル以上 |
| 最安プランでの扱い | スターターは消費税の申告が対象外 | パーソナルミニは「消費税申告は利用できません」と明記 |
出典：freee会計 料金プラン、マネーフォワード クラウド確定申告 料金。
インボイス登録している人が最安プランを選ぶと、消費税の申告のときにプランを上げる必要があります。最初から、freeeならスタンダード、マネーフォワードならパーソナル以上で比べてください。
登録するかどうかの判断や、2026年10月からの経過措置、2027年分から始まる3割特例については、インボイス2026年10月改正｜フリーランスの登録判断と対応手順にまとめています。まだ登録していない人は、先にそちらで立場を決めてからプランを選ぶと迷いません。
Stripe・PayPalの売上の取り込み
Web制作の売上は、銀行振込のほかに、StripeやPayPalで受け取ることがあります。どちらも両社で取り込めますが、PayPalの外貨の扱いが違います。
| freee会計 | マネーフォワード クラウド確定申告 | |
|---|---|---|
| Stripe | Stripeを口座として登録すると、売上データを自動で取り込む | クラウド会計・確定申告とAPI連携できるサービスの一覧に掲載 |
| PayPal | 日本円の明細だけを同期する（外貨は対象外）。取得できるのは過去3年分 | 取引明細を取得する（残高は取得しない）。外貨は取引日の三菱UFJ銀行の仲値で円に換算 |
出典：freeeヘルプ「Stripe – 売上データを取り込む」（2026年9月10日更新）・「PayPal – 購入履歴・売上データを取り込む」（2026年6月11日更新）、マネーフォワード「API連携に対応している連携サービス」（2026年7月13日更新）・「PayPalとの連携」（2026年7月8日更新）。
海外の取引先からPayPalでドル建ての報酬を受け取っている人は、外貨を円に換算して取り込めるマネーフォワードの方が手間が少なくなります。freeeは日本円の明細だけを同期するため、外貨の売上は、円に換算して手動で登録するか、freeeのヘルプが案内している外貨建取引管理のアプリを使って記帳します。
Stripeについては、freeeはヘルプで取り込みの手順と取得できるデータを公開しています。マネーフォワードは連携の対応サービスとして掲載していますが、取得できるデータの詳細は同じページに書かれていません。Stripeの売上が多い人は、無料期間中に先月分を取り込んで確かめてください。
Stripeで月額課金を運用している場合、会計ソフトに取り込む前に、Stripe側の請求データが正しく作られていることが前提です。プラン変更や解約の扱いはStripeサブスク課金の設計と運用で整理しています。
請求書の作成（インボイスの6項目）
請求書は、freeeは全プランで作成できます。マネーフォワードは請求書サービスとの連携が全プランの基本料金に含まれ、作成・メール送付の一括操作はパーソナル以上の機能です。料金ページの記載は次のとおりです。
| freee会計 | マネーフォワード クラウド確定申告 | |
|---|---|---|
| 料金ページの記載 | 見積書・請求書の作成は全プラン共通 | 「請求書作成・メール送付の一括操作」をパーソナルの主な機能として記載 |
| 最安プランでの扱い | スターターでも作成できる | パーソナルミニでも請求書サービスとの連携は利用できる（一括操作はパーソナル以上） |
出典：freee会計 料金プラン、マネーフォワード クラウド確定申告 料金。
インボイスとして通用させるには、登録番号や税率ごとの消費税額など6つの項目が請求書に入っている必要があります。項目の一覧とWeb制作での書き方の例は、インボイス対応手順の記事の「Web制作の請求書に入れる6項目」にあります。
ソフトで請求書を作ったら、6項目がすべて表示されているかを1枚目で確かめます。特に、登録番号と「10%対象の金額」「消費税額」が別の行に出ているかを見てください。
無料期間の違い
どちらも無料で試せる期間があります。2026年9月時点で、両社の料金ページに無料プランの掲載はありません。
| freee会計 | マネーフォワード クラウド確定申告 | |
|---|---|---|
| 無料で試せる期間 | 30日間（全プラン。料金ページでは「今なら」と表記） | 1か月（1事業者につき1回） |
| 始めるときに必要なもの | メールアドレスだけ（クレジットカードは不要） | メールアドレスで登録（クレジットカードは不要） |
| 期間が終わったあと | （料金ページに記載なし） | 有料プランへ自動で移行しない。続ける場合は有料プランの申込時にクレジットカードを登録する |
| 試せる機能 | （料金ページに記載なし） | トライアル中は一部の機能が使えない（個人はパーソナル相当の機能で試す） |
出典：freee会計 料金プラン、マネーフォワード クラウド確定申告 料金（2026年9月19日時点）。
両方を並べて試すなら、無料期間が重なるように同じ週に始めます。後で説明する確認項目を、同じ月の売上で両方に通すと比べやすくなります。
選び方の判断表（登録状況 × 売上の経路）
ここまでの比較を、インボイスの登録状況と売上の経路で整理します。
| 登録状況 | 売上の主な経路 | 向いている選択 | 理由 |
|---|---|---|---|
| 登録済み | 銀行振込が中心 | マネーフォワード パーソナル | 消費税の申告ができるプランがfreeeより年8,400円安い |
| 登録済み | PayPal（外貨あり） | マネーフォワード パーソナル | 外貨を円に換算して取り込める |
| 登録済み | Stripe | 両方を試して決める | freeeは取り込み手順と取得データをヘルプで公開。マネーフォワードはAPI連携の対応一覧に掲載 |
| 免税のまま | 銀行振込が中心 | どちらでもよい | 最安プランの差は年960円。画面の使いやすさで選ぶ |
| 免税のまま | PayPal（外貨あり） | マネーフォワード | 外貨を円に換算して取り込める。トライアルはパーソナル相当の機能で動くため、パーソナルミニでPayPal連携が使えるかはサポートに確認する |
迷ったら、年間の売上のうちPayPalとStripeで受け取った割合を出してください。割合が大きいほど、取り込みの違いが毎月の手間に響きます。
無料期間中に確かめる5項目
無料期間のうちに、次の5項目を確かめます。すべて先月1か月分の実際のデータで試すのがポイントです。
- 売上の取り込み：StripeかPayPalを連携し、先月分の売上の件数と合計金額が、Stripe・PayPalの管理画面の数字と一致するか
- 決済手数料の扱い：Stripe・PayPalの手数料が、売上とは別の行として取り込まれるか、自分で登録する必要があるか
- 請求書：請求書を1枚作り、登録番号と「10%対象の金額」「消費税額」を含む6項目が表示されるか
- 銀行口座・カード：事業用の口座とカードを連携し、先月の経費が取り込まれるか
- 消費税の申告（登録済みの人）：選ぶ予定のプランで、2割特例（2027年分・2028年分は、要件を満たせば3割特例）の申告に進めるか
合格ラインは、日本円の売上なら、1つ目の売上の合計が管理画面の数字と1円単位で一致することです。外貨の売上は円に換算されるため、件数が一致していることと、換算に使われたレートを確かめます（マネーフォワードは取引日の三菱UFJ銀行の仲値）。一致しない場合は、返金や手数料の扱いが原因のことが多いので、差額の取引を1件ずつ見比べます。
マネーフォワードはトライアル中に一部の機能が使えないため、5つ目が試せない場合があります。その場合は料金ページで、選ぶプランの機能一覧に消費税の申告が入っていることを確かめてください。
5項目のうち、両社で結果が分かれた項目があれば、それが選ぶ理由になります。副業でどれくらいの時間を制作に使えるかによって、記帳にかけられる時間も変わります。時間の見積もり方は副業Web制作の現実｜週何時間なら案件を受けられるかで扱っています。
よくある質問
Q. freeeとマネーフォワード、安いのはどちらですか？
2026年9月時点の年払い（税抜）では、どちらもマネーフォワードの方が安くなります。インボイス登録している人が使う消費税申告のできるプランは、freeeのスタンダードが23,760円、マネーフォワードのパーソナルが15,360円で、差は8,400円です。免税の人向けの最安プランは11,760円と10,800円です。
Q. インボイス登録していても、いちばん安いプランで足りますか？
足りません。freeeのスターターとマネーフォワードのパーソナルミニは、どちらも消費税の申告ができません。インボイス登録している人は、freeeならスタンダード以上、マネーフォワードならパーソナル以上を選びます。
Q. Stripeの売上は、どちらでも自動で取り込めますか？
freeeは、Stripeを口座として登録すると売上データを自動で取り込むと、ヘルプで説明しています。マネーフォワードは、Stripeをクラウド会計・確定申告とAPI連携できるサービスとして掲載しています。取得できるデータの範囲は、無料期間中に先月分を取り込んで確かめるのが確実です。
Q. PayPalでドル建ての報酬を受け取っています。どちらが向いていますか？
マネーフォワードが向いています。取引日の三菱UFJ銀行の仲値で円に換算して取り込みます。freeeのPayPal連携は日本円の明細だけを同期するため、外貨の売上は別に記帳することになります。
Q. 無料期間が終わると、自動で課金されますか？
マネーフォワードは、無料トライアルから有料プランへ自動で移行しないと料金ページに明記しており、続ける場合は申込時にクレジットカードを登録します。freeeは料金ページに期間終了後の扱いの記載はありませんが、メールアドレスだけで始められ、クレジットカードの登録は不要です。どちらもカードを登録せずに試せます。
Q. 副業のWeb制作でも会計ソフトは必要ですか？
確定申告が必要なら、帳簿をつけるために使うと手間が減ります。源泉徴収の対象となる給与を1か所から受けている人は、給与以外の所得（売上から経費を引いた額）の合計が20万円を超えると確定申告が必要です。20万円以下でも、住民税の申告は別に必要になります。
確定申告が必要な条件の出典：国税庁 No.1900 給与所得者で確定申告が必要な人。住民税の申告の出典：名古屋市 公式FAQ（所得税の確定申告をした場合、住民税の申告は別に出さなくてよい）。